Temiz odaların kullanım amaçları sektörlere göre farklılık gösterebilir. Hastaneler, ilaç üretimi, gıda üretimi vb alanlarda temiz oda kullanımı havada uçuşan mikroorganizmaların temizlenmesi, odalar arasındaki çapraz bulaşmanın önlenmesi ve mikroorganizmaların insan ve ürüne zarar vermesinin engellenmesidir. Mikroçip üretimi, ekran üretimi ve uydu yapımı gibi endüstriyel alanlarda ise havada uçuşan taneciklerin ürüne zarar vermesini engellemek için temiz odalar kullanılır.
Temiz oda, hava kalitesinin mükemmel bir şekilde kontrol edildiği, ısının, nemin, basıncın ayarlandığı ve partikül veya mikroorganizma kontaminasyonunun kontrol edildiği hacimlerdir.
